Wybitni polscy naukowcy i publicyści wystosowali list otwarty do dyrektora Muzeum Historii Żydów Polskich, Dariusza Stoli, w którym potępili haniebny incydent na terenie muzeum, dokonany przez Adama Michnika, który w plugawy sposób szkalował profesora Chodakiewicza. W liście czytamy: „W dniu 11 maja br. podczas dyskusji odbywającej się na terenie Muzeum Historii Żydów Polskich Polin doszło do haniebnego incydentu. Jeden z jej uczestników, Adam Michnik, posługując się mową nienawiści, w sposób niegodny i zahaczający o paranoję obraził czołowego amerykańskiego historyka pochodzenia polskiego, prof. Marka Jana Chodakiewicza, porównując go do Adolfa Hitlera. Z kolei o pracach prof. Chodakiewicza powiedział: „One powinny stać na jednej półce z >>Protokołami mędrców Syjonu<<". Wyrażamy głębokie oburzenie, że na terenie kierowanej przez Pana placówki takie słowa padły wobec człowieka, który decyzją prezydenta Stanów Zjednoczonych, Georga Busha, został powołany do amerykańskiej Rady Pamięci Holokaustu (US Holocaust Memorial Council), a od 2008 r. jest kierownikiem Katedry Studiów Polskich im. Tadeusza Kościuszki (The Kosciuszko Chair of Polish Studies) na waszyngtońskiej uczelni IWP, jednej z nielicznych instytucji zachodnich prezentujących historię Polski w oparciu o najwyższe standardy naukowe. Przypominamy, że Polin utrzymywany jest przez polskiego podatnika i ma służyć prezentacji żydowskiej kultury i historii, oraz szerzeniu tolerancji i otwartości, a nie podłości, nikczemności i nienawiści skierowanej w wybitnych przedstawicieli polskiego życia naukowego. Wzywamy Pana Dyrektora do oficjalnego przeproszenia prof. Chodakiewicza i poinformowania opinii publicznej o działaniach podjętych w celu niedopuszczenia do powtórzenia się w przyszłości takich haniebnych incydentów, które nie tylko rzutują na dobre imię kierowanej przez Pana instytucji, ale potwierdzają zarzuty jej krytyków, którzy dowodzą, że może stać się ona źródłem konfliktów, wykluczania i mowy nienawiści. Jednocześnie wskazujemy, że zaniechanie powyższych działań może świadczyć o tym, że opisywane skandaliczne i haniebne zachowanie prelegenta nie jest jedynie incydentem, a świadomą polityką kierowanego przez Pana Muzeum.   List otwarty w obronie profesora Chodakiewicza podpisali:   Ks. prof. dr hab. Roman Dzwonkowski SAC - historyk, socjolog Prof. dr hab. Marek Kornat - IH PAN Prof. dr hab. Jan Żaryn - historyk, senator RP Prof. dr hab. Adam Wielomski - historyk idei Prof. dr hab. Henryk Głębocki - historyk Prof. dr hab. Wojciech Polak - historyk Prof. dr hab. Marek Wierzbicki - historyk Dr hab. Tomasz Panfil - prof. KUL, historyk Dr hab. Mirosław Szumiło - historyk, UMCS Dr hab. Krzysztof Kaczmarski – historyk Dr hab. Andrzej Zybertowicz - socjolog Dr hab. Elżbieta Wojcieszek – historyk Dr hab. Bogdan Musiał - historyk Dr Krzysztof A. Tochman – historyk, pisarz Dr Mariusz Krzysztofiński - historyk Dr Piotr Gawryszczak - historyk, radny Rady Miasta Lublina Leszek Żebrowski - historyk, publicysta Dr Tomasz Sommer – historyk, publicysta Jan Pospieszalski – publicysta Dr Tomasz Teluk – publicysta Dr Jolanta Mysiakowska Muszyńska - historyk Dr Wojciech J. Muszyński - historyk Dr Rafał Łatka - historyk Dr Rafał Drabik - historyk Dr Rafał Dobrowolski - historyk Dr Rafał Sierchuła – historyk Dr Marcin Wałdoch - historyk Michał Wołłejko - historyk, publicysta Tadeusz M. Płużański – historyk, publicysta Stanisław Michalkiewicz – prawnik, publicysta Krzysztof Wyszkowski – publicysta Maciej Duszyński - politolog Tomasz Rzymkowski - prawnik, poseł na Sejm RP Dariusz Loranty - publicysta Rafał Otoka-Frąckiewicz - publicysta Dr Marta Cywińska – pisarka, publicystka Jerzy Kenig - publicysta Jacek Gratkowski - historyk, publicysta Piotr Koczur - historyk   Jan Bodakowski